倒置熒光顯微鏡由熒光附件與倒置顯微鏡有機(jī)結(jié)合構(gòu)成的，主要用于細(xì)胞等活體組織的熒光、相差觀察。是為了適應(yīng)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域中的組織培養(yǎng)、細(xì)胞離體培養(yǎng)、浮游生物、環(huán)境保護(hù)、食品檢驗(yàn)等顯微觀察。由于這些活體被檢物體均放置在培養(yǎng)皿（或培養(yǎng)瓶）中，這樣就要求倒置顯微鏡的物鏡和聚光鏡的工作距離很長，能直接對培養(yǎng)皿中的被檢物體進(jìn)行顯微觀察和研究。因此，物鏡、聚光鏡和光源的位置都顛倒過來，故稱為"倒置顯微鏡"。

倒置熒光顯微鏡是近代發(fā)展起來的新式熒光顯微鏡，特點(diǎn)是激發(fā)光從物鏡向下落射到標(biāo)本表面，即用同一物鏡作為照明聚光器和收集熒光的物鏡。光路中需加上一個(gè)雙色束分離器，它與光鈾呈45°角，激發(fā)光被反射到物鏡中，并聚集在樣品上，樣品所產(chǎn)生的熒光以及由物鏡透鏡表面、蓋玻片表面反射的激發(fā)光同時(shí)進(jìn)入物鏡，反回到雙色束分離器，使激發(fā)光和熒光分開，殘余激發(fā)光再被阻斷濾片吸收。

倒置熒光顯微鏡有圖像輸出系統(tǒng)，可將傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡與電腦計(jì)算機(jī)(數(shù)碼相機(jī))通過專業(yè)的工業(yè)相機(jī)連接，可以在目鏡筒上進(jìn)行直接觀察，還能在電腦計(jì)算機(jī)(數(shù)碼相機(jī))等顯示設(shè)備實(shí)時(shí)進(jìn)行觀察，可以方便的將觀察畫面及動態(tài)視頻進(jìn)行保存和打印。

其攝影技術(shù)對于記錄熒光圖像十分必要，由于熒光很易褪色減弱，要即時(shí)攝影記錄結(jié)果。方法與普通顯微攝影技術(shù)基本相同，只是需要采用高速感光膠片即可。因紫外光對熒光猝滅作用大，如FITC的標(biāo)記物，在紫外光下照射30s，熒光亮度降低50%。所以，曝光速度太慢，就不能將熒光圖像拍攝下來。

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